জৈব যৌগের উৎস মূলত দুই ধরনের ১) প্রাকৃতিক উৎস ও ২) কৃত্রিম উৎস 

১) প্রাকৃতিক উৎসঃ জৈব যৌগের প্রধান প্রাকৃতিক উৎস হচ্ছে জীবজন্তু, গাছপালা, খনিজ কয়লা, পেট্রোলিয়াম, প্রাকৃতিক গ্যাস ইত্যাদি। 

২) কৃত্রিম উৎসঃ আগে জৈব যৌগ কৃত্রিমভাবে প্রস্তুত করা যেত না। 

কিন্তু বর্তমানে অধিকাংশ জৈব যৌগ কৃত্তিম সংশ্লেষণের মাধ্যমে পরীক্ষাগারে ও শিল্প প্রণালীতে প্রস্তুত করা যায়।