সিগমা ও পাই বন্ধনের মধ্যে পার্থক্য নিম্নরূপঃ 

১. সিগমা বন্ধন শক্তিশালী কারণ এখানে অরবিটালের সামনাসামনি অধিক্রমণ ঘটে। 

কিন্তু পাই বন্ধন দুর্বল কারণ এখানে অরবিটাল এর পাশাপাশি অধিক্রমন ঘটে। 

২. সিগমা বন্ধন ভাঙতে অধিক শক্তির প্রয়োজন হয়। তাই সিগমা বন্ধন সৃষ্ট যৌগ সহজে বিক্রিয়া দেয় না। বন্ধন ভেঙ্গে প্রতিস্থাপন, অপসারণ ও পুনঃবিন্যাস বিক্রিয়া ঘটে।

কিন্তু পাই বন্ধন সৃষ্ট যৌগ সক্রিয় হয়। অতি সহজে যুত বিক্রিয়া দেয়। 

৩. সকল একক বন্ধনী সিগমা বন্ধন দ্বারা গঠিত। 

কিন্তু একটি সিগমা বন্ধন এর সাথে একটি বা দুটি পাই বন্ধনযুক্ত হয়ে যথাক্রমে দ্বিবন্ধন ও ত্রিবন্ধন গঠন করে। 

৪. দ্বিবন্ধন যুক্ত পরমাণু মুক্তভাবে ঘুরতে পারে। 

কিন্তু পাই বন্ধন যুক্ত যৌগের মুক্ত ঘূর্ণন সম্ভব নয়।